Uncanny X-Men #220Nightcrawler y Shadowcat quedan de reservistas en tanto se recuperan, miniserie Fantastic Four Vs X-Men #1 al #4, 1987).Para salvar la vida de Kitty, los Xmen tienen que aliarse con Dr. Doom lo que provoca una confrontacion con los Fantastic Four y amigos, en esta ocasion los Xmen de Magneto son los vencedores (la batalla entre Rogue y Thing es muy powa XDD).
Uncanny X-Men #221(Septiembre, 1987): Primera aparición de Mister Sinister, como la mente maestra detras del ataque de Mutant Massacre, rompiendole el cuello a Sabretooth -que en realidad era un clon-.
Uncanny X-Men #224 - #227, X-Factor #24 - #26 y New Mutants #59 - #61
(Enero-Marzo, 1988): FALL OF MUTANTS.

Los X-Men se unen a Forge en una lucha contra Adversary, el villano megapoderoso, y sus planes de destruir el mundo. Storm y Forge son exiliados a otra dimensión mística donde pasan un año (en nuestro mundo, solo transcurrieron unas horas). Storm recupera sus poderes. Por su parte, Cameron Hodge deja en bancarrota a Archangel y X-Factor, pero falla en su intento de matarlos y es vencido. Los X-Men mueren al derrotar a Adversary, pero en gratitud a su sacrificio, la Guardia Universal Roma los revive. Los X-Men deciden hacer creer a todo el mundo que siguen muertos, para trabajar más libremente. Al mismo tiempo, Doug Ramsey, de los New Mutants, muere, y Magneto siente que le fallo a Xavier, pues Doug y los X-Men han muerto.

Uncanny X-Men #229(Mayo, 1988): Primeras apariciones de los Reavers (Androides criminales: Pretty Boy, Skullbuster, Bonebreaker, Stanley, Ollie y muchos más) y el portal místico Siege Perilous (Portal que permite a quien lo atraviesa "volver a nacer", o lo que es lo mismo, tener otra vida). Los X-Men se reubican en Australia, en el antiguo cuartel de los Reavers. Magneto ya solamente dirige a los New Mutants.
EXCALIBUR SPECIAL EDITION(Verano, 1988): Nightcrawler y Shadowcat, creyendo que los X-Men han muerto, van a Inglaterra y crean al equipo mutante Excalibur, con ayuda de Phoenix II y junto a Captain Britain y Meggan.
Uncanny X-Men #235(Octubre, 1988): Primera aparición de la isla-nación Genosha, poderosa potencia que utiliza mutantes como esclavos controlandolos con un collar restrictor de poderes.
Wolverine #1(Noviembre, 1988): Wolverine se convierte en el primer mutante en obtener sus propio comic regular, en sus primeros numeros veremos como Wolvie se convierte en un temido "gangster" de la isla-nacion Madripoor, con el nombre codigo "Patch".
Uncanny X-Men #239 - #242, New Mutants #71 - #73 y X-Factor #36 - #39


(Enero-Abril, 1989): INFIERNO: X-Over donde los X-Men combaten a una invasión de demonios, dirigidos por N´astirh, maximo demonio que ha hecho una alianza con Sinister. Madelyne Pryor se convierte en Goblin Queen -despertando todo el poder de Dark Phoenix, al ser clon de Jean Grey- y Mister Sinister interviene con sus maquinaciones. Se revela el origen de Madelyne como clon de Jean Grey. Finalmente X-Factor hace las paces con los Xmen, Wolverine y Jean vuelven a ser amigos.

New Mutants #75(Mayo, 1989): Magneto cae en la cuenta de que los métodos de Xavier no son para él, y abandona todo exiliandose en el asteroide M, dejando a los New Mutants abandonados en la mansion X.
Uncanny X-Men #244(Mayo, 1989): Primera aparición de Jubilee, quien aprovechando un portal teletransportador que usan las chicas-X en Los Angeles, abandona su aburrida vida de ladrona y se instala secretamente en el cuartel en Australia, desarrollando una admiracion por Wolverine.
Uncanny X-Men #247(Agosto, 1989): Los Xmen consiguen destruir a los Super-Sentinels Master Mold y el Sentinel del futuro, pero Rogue cae accidentalmente en el Siege Perilous, los Xmen creen que ha muerto.
Uncanny X-Men #248(Septiembre, 1989): Longshot abandona a los X-Men en busca de su pasado. Pronto se sabe que regreso a Mojoverse, como el lider de la resistencia contra el villano Mojo.
Uncanny X-Men #249(Noviembre, 1989): Desesperados porque las cosas no les han salido bien últimamente, Storm, Colossus, Psylocke, Dazzler y Havok atraviesan el Siege Perilous, del cual quizas nunca salgan mas. Wolverine queda como unico Xman, en Australia.

Fin de esta Era :P